1、巧克力囊腫與不孕之間的關系誤區：巧克力囊腫是子宮內膜異位癥的并發表現之一，子宮內膜異位癥的三大危害分別是不孕、痛經、內膜異位囊腫即巧克力囊腫，單純治療囊腫是容易的，也對懷孕有幫助，但是，不孕的原因很復雜，治好巧克力囊腫不一定就會懷孕。即：治巧克力囊腫易，治內膜異位不孕難。

　　2、手術、腹腔鏡與介入的認識誤區：據文獻報告，手術治療內膜異位囊腫復發率是22.9%,引起粘連及包裹性囊腫5.4%，而介入一次性治愈率是73%，都不能完全根治，都需要系統的服藥才能鞏固療效，減少復發或再發。這三種方法與內科保守治療不矛盾，有的是需要相互借用的，取長補短。只是介入治療方法簡單，損傷輕微，利于反復治療，而且費用也低很多，特別是開腹或腔鏡術后復發者以及包裹性積液性囊腫因腹腔粘連，不能再次手術治療的病人，介入治療是很好的選擇。

　　3、治療科室的認識誤區：大多數巧克力囊腫病人是在婦產科看病，到超聲科檢查，婦產科醫生會推薦手術，特別是腹腔鏡手術，因為這是婦產科醫生的熟練的強項，做介入治療多數為超聲科的超聲介入做，目前，不是所有的超聲科都開展了此項業務，開展的醫院也不多，患者可以多咨詢。

　　4、無水酒精對卵巢的損傷的認識誤區：只有生長于卵巢上的內膜異位囊腫才有可能損傷卵巢，但酒精的滲透力是有限的，能將囊腫壁上的異位內膜細胞徹底凝固就已謝天謝地了，開展此項工作10多年來，尚沒有見報道有確切的證據證明無水酒精對卵巢有硬化作用，退一步講，幾分鐘的無水酒精凝固對卵巢的影響總比手術切掉或部分切掉的影響要小很多吧。另外，我們現在也有不使用無水酒精的硬化劑，對酒精過敏的病人或需要內分泌治療的人可以選擇，而且療效好，副作用要低。

　　5、囊腫皮的問題：內膜異位囊腫即巧克力囊腫是良性病變，只要消除囊腫，囊壁是自已正常組織，多為腹膜，會通過自身的組織修復而得以吸收，不會對身體產生影響。

　　6、治療效果的認識誤區：囊腫介入治療以抽囊液后，注入硬化劑使囊壁細胞凝固性壞死，形成無菌性炎癥，治療最初一段時間，(1周到1月)會產生滲出，使囊內產生較多的滲出液，1個月后滲出停止，開始吸收，囊液逐漸減少至消失，最后囊腫完全閉合，才叫治愈，一般3-6個月絕大部分的囊腫會消失，極少數人可能達1年才完全消失。治療完全消失叫治愈，縮小大半叫顯效，縮小小半叫有效，3-6個月后完全不縮小叫無效。

　　7、不孕癥的治療誤區：現代社會不孕癥的發病率越來越多，與社會生活壓力大，環境影響，婚前過早性生活，頻繁人工流產等女方男方因素有關，原因復雜，男性精子質量總體下降，女性子宮、輸卵管、卵巢卵子眾多因素中只要有一個出現問題，就會影響受孕。但現在科技的發展也可使90%不孕癥獲得生育機會。一是卵泡監測，輸卵管通暢試驗，子宮的檢查，男方的精液檢查，基礎體溫的監測，等系列治療，一般來講，我們觀察，內膜囊腫治療半年內仍沒懷孕的，自然懷孕的機率要小得多，可能需要人工試管等人工助孕的手段來得到小寶寶了。