寶寶厭食癥的成因可能與下面這些因素有關：
　　1、全身性疾病如結核病、膠原病、貧血及一些慢性感染等。
　　2、消化道變態反應及服用易引起惡心、嘔吐的藥物，如紅霉素、氯霉素、磺胺類藥物以及氨茶堿等也可導致厭食。 
　　3、胃腸道疾病。如消化性潰瘍;急慢性肝炎;慢性腸炎、各種原因的腹瀉及慢性便秘等都是常見的原因。 
　　4、鋅缺乏以及缺乏某些內分泌時，如甲狀腺功能低下等。 
　　5、其他如肝功能不全、高血壓、酸中毒、尿毒癥、心功能不全以及消化道淤血。 
　　6、維生素A或維生素D中毒等。 
　　7、情緒變化引起的厭食。進食采取不適當的溺愛態度，反而引起小兒神經性厭食。 
　　8、不良的飲食習慣。高蛋白、高糖的飲食使食欲降低;兩餐之間隨意的吃水果、點心、花生、瓜子等零食;以及吃飯不定時、生活不規律;冷飲及飲料均影響消化液的分泌，進而影響食欲。
　　據調查，1-7歲患小兒厭食癥的兒童中，僅有17%的兒童是因為疾病造成的，而83%的患兒都是因為食物結構不合理、飲食習慣不良所致。