功能性不射精癥有以下三種原因：
       
　　（1）中樞性射精障礙：主要起因于大腦功能異常，對興奮的抑制性加強，尤其是對射精中樞抑制性更為明顯，故患者無性欲高潮和射精動作。亦有少數病例是因智力障礙、感情壓抑、感覺器官異常等造成不射精。
       
　　（2）心理因素性射精障礙：這種類型純屬心理因素所致，其射精障礙既沒有中樞性的功能障礙，也沒有生殖系統的器質性疾患。
       
　　（3）脊髓性中樞性射精障礙：由于腰骶髓內射精中樞和勃起中樞功能紊亂或衰竭，導致了射精遲緩以至完全不能射精。