前面已經談到了治療醫學的醫患關系，是醫生主導著整個治療的全過程，患者僅僅是遵照醫囑的被動求治者。而疾病是病患者自身行為的產物，因此在康復醫學中，改變自身不健康的心理、生理行為將被提升到康復疾病、重獲健康的主導地位。在未來的氣功康復醫學中，患者自己修心養性、改變不健康的心理行為，將是康復一切疾病的決定性因素。而當今醫學界流行的一切外在的治療手段，包括手術、用藥及各種理化的手段，將被降為不得已時（如搶救危重病人時）才謹慎使用的輔助手段。
2．氣功康復醫學以激發患者的康復系統為基本點
人類的各種疾病都與自身的行為有著十分密切的關系，可以說：行為是因、疾病是果。即便是意外的傷害或外來病毒的感染，也離不開自身行為的不當及體內環境失調這個最基本的因素。“外因必通過內因才能起作用”。在各種傳染病的高發區內，依然會有不少人安然無恙、未被感染，這便是最好的證明。
因此氣功康復醫學，強調患者修煉真正有效的醫療氣功（而非目前社會上流行的普通健身氣功及概念不清的各種似是而非、也自稱為“氣功”的肢體運動），以快速激發病患者的各種身體潛能，改導致疾病發生的身體內環境，充分調動被各種藥物或其他心理、生理的原因所深深抑制下去的自愈能力和康復系統，使疾病得到有效的康復。
人體康復系統有以下三大子系統組成：
（1）抵抗外來細菌病毒感染的肌體免疫系統
免疫系統是保證人體不受外來細菌感染、抵御外部風寒侵襲的保護系統，一個免疫系統強健的人，一般很少或基本不會得病。即便偶患小疾，也會很快康復。
（2）康復疾病的肌體自愈系統
自愈系統是所有生命所共有的，人類當然也不例外。在我們身邊，隨處可見不少人得病后無藥康復的例子，這便是人類自身的自愈系統在起著康復作用。
（3）修復肌體缺損的生命再造系統
自然界中的各種野生動植物，都有著十分頑強的生命再造功能，中國詩詞中有“野火燒不盡，春風吹又生”的千古絕句，便是對各種野生植物頑強的生命力的真實寫照。不少動物如壁虎的尾巴斷了，不久又能長出新尾巴來，螃蟹的大鉗子掉后也可以重新長出新的大腿，自然界的不少動物都有再生功能。人類作為原始地球環境的產物之一，本來也具有同樣的功能，但隨著人類的物質文明及醫學的不斷發展，許多功能被藥物取代、長期廢棄不用而退化了。
一個人如果免疫系統健全，就可以有效防止各種外來的疾病；自愈系統健全便可以及時康復已患的各種疾病；再造系統強的人，即便因傷因病造成肌體局部的缺損，也可以再造修復。
因此，氣功康復醫學緊緊抓住疾病康復的這個基本點，利用一切確實有效的手段，利用氣功修煉可以快速激發人體潛能這一獨特優勢，快速調動和激發人體康復系統及三大子系統，使各種醫藥無法治愈的各種慢性頑癥，得到真正有效的康復。
3．身心并練、標本兼治，宏觀調整整體健康
“身”即身體（軀體），“心”即心靈（精神、意識或稱靈魂）。人體的各種疾病，從氣功康復醫學的角度分，可分成兩大類：
一類是來自物質領域的傷害，如物理傷害，車禍、外傷、運動創傷等；又如：細菌病毒的入侵感染等都屬于來自于物質領域的傷害。對于這類疾病治療醫學有一定的針對性，因此療效比較確切。
另一類為非物質領域的傷害，如受到不健康的精神、情緒的長期控制而導致的病變，這類疾病沒有明確的致病原因，病因復雜，病變遷延時間長，絕大多數慢性疾病都屬于此類。這類疾病治療醫學僅局限于對癥治療，但由于缺乏對疾病發生原因的整體認識，因此基本無確切療效。
氣功康復醫學注重身心并練，經過有效的醫療氣功修練，快速形成的體內真氣，既可以直接疏通、修復軀體的病變，同時又可以舒展精神心靈的扭曲，使許多慢性疾病的發病原因真正得到解決，使各種慢性頑癥得到康復。
4．轉變觀念 ,用良好的意念調控自身的疾病
人的意識是有能量的，這一點已經在大量的科學實驗中得到了反證，在氣功康復醫學的臨床中，更是雄辯地證明了良性、積極的意識可以使疾病得以康復，而惡性、消極的意識可以導致疾病惡化，甚至死亡。
氣功康復醫學重視對學員意念力的培養，調動并提高學員念力的量級，并對自身的疾病進行良性的意識調控，達到自我康復的目的。
當然這一切都必須在學員轉變觀念的基礎上進行。轉變觀念，轉變的是舊的思維模式，而舊的思維模式的轉變，又必須建立在破除對現代醫學迷信的基礎上。如：現代醫學認為：晚期癌癥是不可能被戰勝的、心血管疾病、糖尿病等是不可能康復、必須終生服藥等“科學的迷信”。
氣功康復醫學將以能使各種慢性疾病得到真正、有效的康復，又沒有任何副作用的獨特效果被越來越多的人所認識、所接受，并將掀起一場人類醫學觀念的偉大變革！
