在發展中國家,下呼吸道感染通常為主要的死亡原因或僅次于腹瀉.30歲以上的成人肺炎的最常見病因是細菌.其中肺炎鏈球菌最常見.其他病原菌包括厭氧菌,金黃色葡萄球菌,流感嗜血桿菌,肺炎衣原體,鸚鵡熱衣原體,沙眼衣原體,卡他莫拉菌,嗜肺軍團菌,克雷白肺炎桿菌和其他革蘭氏陰性桿菌.肺炎支原體為一種類似細菌的微生物,是年齡較大兒童和青年特別常見的病因,常見于春季.嬰兒和兒童的主要肺炎病原體是病毒：呼吸道合胞病毒,腺病毒,副流感病毒,甲型和乙型流感病毒.這些病原體也能引起成人肺炎；但對原先健康的成人來說,唯一可能嚴重且普遍的病毒是甲型流感病毒,偶爾還有水痘---帶狀皰疹病毒.其他病原體有：更高級的細菌,包括諾卡菌和放線菌；分枝桿菌,包括結核分枝桿菌和非典型菌株(主要為堪薩斯分枝桿菌和鳥型細胞內分枝桿菌)；真菌包括莢膜組織胞漿菌,粗球孢子菌,皮炎芽生菌,新型隱球菌,煙曲菌和有隔膜毛霉菌和卡氏肺囊蟲；以及立克次體,主要為伯納特氏柯克斯氏體(Q熱).