激素替代療法的給藥途徑不僅僅是口服給藥，還有經皮膚給藥，經陰道給藥途徑。
非口服激素替代療法近年來取得了重要進展。口服的途徑給藥，藥物經過肝臟代謝，有些人則擔心對肝臟及胃腸的影響及藥物的全身作用，而選用非口服給藥途徑即局部用藥的途徑。非口服給藥途徑尤其適用于患慢性肝膽疾患、胃腸道疾患、凝血功能障礙不能耐受口服給藥的絕經婦女。
口服激素替代療法常用藥物有：環戍醚乙炔雌二醇(炔雌醚)、結合雌二醇(倍美力)、乙炔雌二醇、戍酸雌二醇、雌三醇、環戍醚乙炔雌三醇(維尼胺)、7-甲異炔諾酮(利維愛)。
經皮膚途徑給藥有三種類型，皮膚霜劑為愛斯妥凝膠;皮膚貼劑為雌二醇貼劑;皮膚埋植劑為雌二醇。
經陰道途徑給藥有雌三醇栓劑，另外口服藥也可通過陰道途徑給藥。特別適用于老年性陰道炎、尿道炎。
總之，應根據不同的心理、生理和病理狀態，選用合適的給藥途徑和最低的劑量，而達到較理想的、長期的治療效果。
